Murat Aygen, 29 Ekim 1971 tarihinde Diyarbakır'da dünyaya gelmiştir. Asıl adı Murat Ağlatçı olan oyuncu, İstanbul Üniversitesi Biyoloji Bölümü'nden mezun olduktan sonra Mimar Sinan Üniversitesi Devlet Konservatuvarı'nda oyunculuk eğitimi almıştır. Kariyerine tiyatro sahnelerinde başlayan Aygen, daha sonra televizyon ve sinema dünyasında adını duyurmuştur.
Murat Aygen, televizyon dünyasında birçok başarılı projede yer almıştır. Özellikle Medcezir dizisindeki "Faruk Beylice" karakteriyle geniş bir hayran kitlesine ulaşmıştır. Ayrıca Mucize Doktor dizisinde canlandırdığı "Tanju Korman" karakteriyle de büyük beğeni toplamıştır. 2021-2023 yılları arasında Yasak Elma dizisinde "Doğan Yıldırım" karakterine hayat vermiştir. Sinema kariyerinde ise Ankara Ekspresi ve Av Mevsimi gibi yapımlarda rol almıştır. Şu anda Teşkilat dizisinde Tufan karakterini canlandırmaktadır.
Murat Aygen, oyunculuk kariyerinin yanı sıra müzikle de ilgilenmiş ve çeşitli projelerde yer almıştır. 2010 yılında Nihan Aslı Elmas ile evlenen oyuncunun bir çocuğu bulunmaktadır.
